Как вставить javascript с помощью innerHTML (ie6 дает мне неизвестную ошибку времени выполнения)

Вместо этого попробуйте свойство text. :

newScript.text = '$(window).load(function(){ someFooo(); });';

Это работает и в браузерах, отличных от IE. Я использовал это в FF2, FF3, FF3.5, Safari 4 (win), Opera 9+, Chrome 2, Chrome 3, и все они работают.

Согласно спецификации (я должен сказать это, иначе я чувствую, что ввожу в заблуждение), вы должны использовать appendChild:

var script = '$(window).load(function(){ someFooo(); });';
newScript.appendChild(document.createTextNode(script));

Но это не работает в IE (элементы <script> не могут иметь дочерние элементы или какие-то другие бессмысленные вещи IE). Так что просто иди с первым.

Похоже, это проблема с использованием innerHTML в элементе только для чтения. Это также происходит, когда вы пытаетесь установить innerHTML в tbody. Согласно документации msdn:

(...) Это также может быть немного сложно, потому что вы не можете использовать innerHTML для прямой инъекции в элемент HEAD или STYLE. (Оба этих тега ТОЛЬКО ДЛЯ ЧТЕНИЯ.) Лучший способ динамически добавлять стили на страницу — дождаться загрузки документа, а затем создать правило в новой таблице стилей.

Почему это атрибут только для чтения? Вот объяснение.

Итак, вам нужно использовать подход DOM для выполнения этой динамической загрузки. Перейдите по этой ссылке, чтобы загрузить внешние ресурсы JavaScript, и этот для встроенных скриптов, как в вашем случае.

    newScript = document.createElement('script');
    newScript.type = 'text/javascript';
    var head = document.getElementsByTagName("head")[0];  
    var src = '$(window).load(function(){ someFooo(); }); ';
    newScript.text = src;
    head.appendChild(newScript);