Я использовал codeigniter zip class и все файлы скачивали 0kb

public function downloadzip($argID){
    $data=$this->Audit_started_model->getZipImagesOfSchool($argID);
    foreach($data as $r):
        $filedata=$r->file_name;
        $filename=base_url()."uploads/files/".$r->file_name;

        if(file_exists("uploads/files/".$filedata))
        {
            $this->zip->add_data($filedata,file_get_contents($filename)); 
        }
    endforeach; 
    $this->zip->download(date('d-M-Y'));
}