nodejs что-то делает после завершения нескольких функций

Для этого можно использовать модуль async. Используйте функцию async.parallel(), поскольку ваш первый и второй фрагменты не зависят друг от друга и могут выполняться асинхронно, но вы хотите, чтобы третий фрагмент выполнялся, когда выполнение первого и второго завершено.

Если предположить, что users, profiles и apiData уже объявлены, ваш код будет выглядеть

function func1(callback){
  if (users) {
   for (var i = 0; i < users.length; i++) {
    apiData.users = getUserDetails(users[i]);
   }
  }
  //invoke callback 
}

function func2(callback){
  if(profiles) {
   for (var i = 0; i < profiles.length; i++) {
    apiData.profiles = getProfileDetails(users[i]);
   }
  }
  //invoke callback
}

var asyncfunc = [];
asyncfunc.push(func1);
asyncfunc.push(func2);

async.parallel(asyncfunc,function(err,result){
  //result is an array which receives the second argument of each function's callback.
  for (var i = 0; i < users.length; i++) {
    saveUserProfile(apiData)
  }
})

ИЗМЕНИТЬ
PS: здесь вы также можете использовать async.series (). В данном случае оба эквивалентны, поскольку функции, обрабатываемые здесь async.parallel(), не используют таймеры и не выполняют задачи ввода-вывода.

callback в каждой функции внутри массива принимает два аргумента. Первый аргумент представляет ошибку, которая равна null, если ошибок нет, второй представляет результат функции, который передается второму аргументу обратного вызова функции async.parallel().