Получение ошибки исключения Java при чтении файла XML

Вам необходимо отключить внешнюю загрузку DTD для парсера. Для этого вы можете создать собственный DocumentBuilder, отключить внешнее DTD loading и передайте это как второй вход в xmlread.

Из скрытой документации xmlread (отображается, если вы открываете файл с помощью edit xmlread):

% Advanced use:
%   Note that FILENAME can also be an InputSource, File, or InputStream object
%   DOMNODE = XMLREAD(FILENAME,...,P,...) where P is a DocumentBuilder object
%   DOMNODE = XMLREAD(FILENAME,...,'-validating',...) will create a validating
%             parser if one was not provided.
%   DOMNODE = XMLREAD(FILENAME,...,ER,...) where ER is an EntityResolver will
%             will set the EntityResolver before parsing
%   DOMNODE = XMLREAD(FILENAME,...,EH,...) where EH is an ErrorHandler will
%             will set the ErrorHandler before parsing
%   [DOMNODE,P] = XMLREAD(FILENAME,...) will return a parser suitable for passing
%             back to XMLREAD for future parses.
%   

В итоге это выглядит примерно так:

% Create the DocumentBuilder
builder = javax.xml.parsers.DocumentBuilderFactory.newInstance;

% Disable validation
builder.setFeature('http://apache.org/xml/features/nonvalidating/load-external-dtd', false);

% Read your file
xml = xmlread(filename, builder);

Помните, что это может потенциально привести к неправильному синтаксическому анализу вашего файла.

Обновить

Итак, посмотрим на это немного внимательнее: как только мы преодолеем ошибку проверки DTD, FEX xml2struct не будет правильно обрабатывать запись DOCTYPE в XML и пытается обработать ее так же, как обычный узел. Вы можете изменить источник xml2struct, чтобы обнаружить это внутренне:

if node.getNodeType == node.DOCUMENT_TYPE_NODE

Однако, вероятно, было бы проще просто удалить все DOCTYPE для всех ваших файлов XML. Следующий сценарий должен уметь это делать.

folder = 'directory/where/all/files/live';

files = dir(fullfile(folder, '*.xml'));

for k = 1:numel(files)
    filename = fullfile(folder, files(k).name);
    fid = fopen(filename, 'rt');
    content = fread(fid, '*char')';
    fclose(fid);

    newcontent = regexprep(content, '\n\s*?<!DOCTYPE.*?(?=\n)', '');

    fout = fopen(filename, 'wt');
    fwrite(fout, newcontent);
    fclose(fout);
end